Durante el año 2005 la Iglesia Luterana Costarricense inició la Pastoral de Inclusión, mediante la cual se desarrollan acciones sociales y espacios litúrgicos donde grupos que tradicionalmente son excluidos de la vivencia de la Fe y la Comunión pudieran celebrar dentro de la vida de la Iglesia.

La Iglesia Luterana Costarricense, Organizaciones del Movimiento Social e instituciones públicas marcharon contra la Homofobia, la Lesbofobia y la Transfobia y sus Derechos Humanos.

 Como parte de las acciones de la ILCO tendientes a reducir el estigma y la discriminación que viven ciertas poblaciones en esta sociedad patriarcal, se han iniciado conversaciones y actividades conjuntas con otras organizaciones, incluido el Movimiento Costarricense de Lucha contra el VIH, en pro de tener un acercamiento a la población transgénero e intersexo de San José.

La agencia de cooperación alemana Pan para el Mundo invitó al coordinador del Proyecto de Derechos Sexuales y Derechos reproductivos, y miembro de la Comisión de Diversidades, a compartir diversas actividades  con el fin de divulgar el trabajo que la ILCO está realizando en los temas: VIH/Sida, Equidad de Género y Masculinidades.